Genomic Feature

ot511

ID
ZDB-ALT-250616-4
Name
ot511
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one delins (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Marc Ekker Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Delins
Variant Location
Chr 9: 5039484 - 5048661 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
CAGACGTTGCCCAGAGGCACCTTCATCTCCTTTCTGAGCTACACGGACATGAATGTTGAATGACAGAATTCCGCAAAACTCTCTCGTAAGGCACAGTAATGCTCAAGACCGCCATCCGGGAATCGTGAGGTACAATTAAATGAGAATAACTTTTTACACACTTCAAGTCCATACTCATCTGCACCAAGTTATTGTAATAAATATGCAATCTTTATGTTTCTACCATTTGACCAGTTCACCGTCGAATCGATCAGTTTTGCCAAGGTAAATTTTGTCTCTGCTTTCAGATTAAACGTACAGTATTAGAATCTTCTCAGGAAAAAGTCCCAGGGGACACAGCTAAATGCAAATGTTTAAAGCTCATTTTAACTAACATGTTAGGGTCATTCATGGTTTAATTGTCACGTTTATTTGCCACTAATGTACCTGCGTTGAGTTCATTTATTCATTGCAAGTATTTGTTAATTTTTAAAAACGATTCATTGCGAAATTTGTCTGAAAATGAATTACTGACTTTGTTAAGGCCAGTAATATGATAAGATTATATACACGCGCGCGCGCATGCACACACACAGGTGAATGCACGTTTCTTGAATTGCCCAAATACGCACTTCATTCATTTAAAGAATAATACCTGTCTAAATAATATAATTACTATTTAGCAAATTTCTTGTCCAGTTTTAATGTCCCTTAGATCAAACAAAACATTAACACTAATAATTCATAAATGAATTGGGGAAAAGGCAAAACATATTTATATACGGATTGATTTTAAAAACAGTATTATGCTATTTGAATATCTCATAAATTCAAACGACCGAAGTAGTTAAATGCGCTATAACTTAGTACATTTTATTTCAACCCGTTTATGCGCATTCCGTGTTCAGAATTAGGGAAAAAAAATATTGAAATTAAATGAATGTCTAGTCATCCTAAAGGCTTACTATAATAGTTCTATTTATTTCTCAATCATACAAACGCATTTTAATCAAGAATTTAGAATCATTTTAAGTAGTTATTTTTCGTCCGTCGACATGATTTTATAATTATTCCATTGACAGATTCGATAGTTCTGAAACACCTGTGGTGATCAACAATATGCATTAACTTCTACCAAATAAAAACAGACCATGCAAAGGAAGATGTATTCATTACGCCGATACAATATGCGAATGTTTAAGCACACTCTTTAAAATAAATGCAAATTAATTTCCCAACGAGTGCATAAAGTTTTCTAACTAAATTATTTAAATTATTAAAACACTTTCGTATTTACTAGGACGTAAATTAGTATTAGGAGGTTTTAAGTGTTTATTAGCCTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTATCTTTTGTTAGTCTAATAAAAAAATGGACAACTTCCCCATCGAAATAAATTTATATCTTGGTCAGCTTTTCTTAAAAACATGAGGCGTTACAAGCAGAGGTGAAAAAAAAACTTTCCTATTTCTGATCCTAAATTTGAGGAAAAACTTTATTATCATTACAGTGAATTTGTCTTCATTTTTCAAAGTAATTAAGAGACACGACTTCTGCATGTAAATGTTACACGTTTTATTTGTAAACATCGAATATTCCTTTCTCATGGAGTTTGGTTCGGACTCGATACCGACCGCGTTGCAGTACATTTAATCAAACCATAGAAAAAGGCAGTGATGATCTTCACACACCTATAGAAGATGCCAAATGAAATCACATATTAGACATTAAACAAAGACAACGGTGATGCGTATGAAATTATTTCAACTGCACCATGCTTTAACTGCAAACTCAAAATAAATATATAAACGTTTATATTAAACAGCAACAATACATACAACACATACAAACAAGGAATGTCTGACAATTTTACAAACACAATGGGTCCCTTTTTACCTGTACAGACGATACTGGTATTTATATCTACATGTGCCATATTTAAAAGTTGTCCCAATACTACGAATCTTTATAAAATCTAATAGACTACATAGTGTCCGGAATATAGTGTGTGTAATAGAGACAAGAGTCTTCTACAACATGCGTCTCCTTTCCACCTGACAGAGATACACAGGCACAAGTTATAAAAGGAAAAAGAACTGTCTCTGTACAAGCTTTATACACATCATATAAATGACATAAATCTATTGAATAGGCATATAGAAATTGCGTATAATACACTCTACTCTGTGAATTTTCCATGAATACGGACGTTTTCAGTTAATGATTAGTAGTGGCGGCTAGATTTTATTATTCAAAATCAGGCAAACTTTTTAAGTGTCTTTTATTGTAGTTTTCCCACATTATTAATGATTTGCTTCCTTATTAAATTGTATTTGTTCACTTTATTTATTTATTATACATTTTGTCTGTTCTGAGAGGATGCTCATGGGCGGGGTGTAAAATTAAATAACAAAATAAATAAACAAACAAAAAAATAAATTAGCAGGTAAATAAATAAATAAATAAATATATAATTAAATAAATAGCCGATAACAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGTTGAGTGCTGTTTTCTTGTTTTCCTCGCTATGAATGTATGATCCTCCAGAAAGCGCACGTCATTTGGCGATGGCTGGTCGTTTTAAAAAATCAAGGTGGTTTAAAAATCAGACTTTAGTTTTTTTAGAGAGAGTCTGTGGAAGTTCTCTGAGGTTGTTTCAAATAGTTTTTTTTCACACTCTGTTTAAAATGGCAGAGTGTCAAGAAACAGTTTGTCGATTATTGCTGGCGGTGGGACGAGATCTTCAAGTTTTAGGTAGAAGATGCGCTGCAGACCCTGTGTGCACAGTGTGCGCAGTTCAGGCAGTTTCCCCAATAGTTTGGACAAATAGTTTGGGCGATTCAAGCCGCCTCCGTTGAAAGTAACTTGATCTTTCAGACAATTTACAATCTTGTTTTGAAGGTCCTCAACTCTTTTGGGTTCTTTCAGTCCGTGTCTCTCTGCAAAAAGAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAATTAAATATAATATTTTTTACAACATATAAAACAGATTTCTTACCATTATAATAAACGGATCTCACCTGTGACCATAGCTAGGGCGGCGATGCATGAGAAAGCAGATATGTCTAAATTCATATTCTGAAGATTAGACGAGAACTCCACTATGGAGTCAATCCACTCGCCAAATCCACGGACGCACTGCAGTCTGTGCAACACCACTCCATTACAGAAGATGAGTTTGCTTTCCATCGGGTTGGACCTGAAATTAACAACGAAGCGCACATTAATAACCGTACTTATTAAACAGGGATTTAAGTGGCTCCTAATTATAGCTGAGCCAATAAAATCTGAAAAAGGAAAAAGACACCTCTGCAGAGGCCTCGGTACCTGTACGCCAGCCGCAACACGAAAAGCTCAAGGAAGGCGGATTCGAACAGCAAGTCCTGGTCTGGTTTAGGAAGGTCAGTGAACCCGGGAATTTTTTCTGCCCATCCGCGGATAATCTCCATGGATCCGGTGAGGAGGTCGTAGAACTGCTGGATGTGTTGTGTGTCATCTCCACTCAGTTGGTAGTCCGGGTTGGCTTGGAACTGGAATTTAATTTAAACATGACTTAATAAGCTCACTTAAAATATATAACCCGTGAAATTGCAAAGCCCATTTCTTAAAAGGGGAGAGTTTTCCCCCTCTTTAATTTAACTTCTGTCTGTATTTCACTTGCTTCTTTCTTGCAAAAGCAATTTAGAGAGTAAAATATGCCACACTAAGTGTTGAAAGATTATAATGAAACACTGCAGGATATTAAATTTAAAATACTTCTGTCCGATTTGCACTTTGAGCGCATCAAGTCATGTGTGCATTTTGACTTTCTTCTTTAAAAGAATTAAATTATGGGTCATTTTAGAGATGAGTGCAATATAACGTACTCTGGTGTAGTCGAGGCTGTTCATGGAGGGATTGGAGTCCACATGAGCTCTGACCAGAGCGCTGATCAAACTGACTGGCGGAGAAGGGGGCGAAGACTCCTGAGGACTTTTGGGTTTGGAGGGTAAACGGCCTCGACGACCCTTTAAGTTGTCGGTCCGGACAACTGTCAAATCAACACAAGACTGTAAATATCAAACGGTTATTGTGCTCGTTGTAACATATAATTCAAATTAATCTTGCTGTAATTCTAAATGGTGTTGCGATGAAAGTACACCAGACGCAAAGTTCCCTCCGTGCGTTTTAGAAGCGATGATAAATACTGTAGCGATTTACCTTCTTTCACCATCCCGACCACCAGGCACTTCTGAAATCTGCAATACTGACATCTGTTTCTCCGACGTTTATCCACAGGACAGTTTTTATTGGCTAAACACACATATTTGGCGTTCTTCTGTACTGTACGCTAAAGAAGGAAAACATATGCAATTAGATGACGAAACATTTGATATTTTATCACGCAAACATTCAGAATGTTTCTGAGTAACAAGTGCGCTTAGCAAAAGAAAAAAAAATTATATACATGTAAAACCTAACTACATTTCCCTAAAATGTTTGAATTTAAAAAAATAAAAAGATCCGCAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCTTCATAATGATGATGATGATTTATTAATCAGCAGTATTATTATCCCTGAACATAATCTAAAAATACCTTAAAAAATCCTTTGCACCCTTCACAAGTTCGGACTCCATAGTGCTGACAAGCCGCGTTGTCCCCACACACCGCACATAAACCTTCGGTAGATGGAGATCCCCGAGACGGAGGTGACGGCACCTGACTGTCCATCAGCTGATGGCCGTGACTGAGCTGAAGTGAGTGGGTGAAAGCGATCCCCGCCTGCTTCCTGATGGTACTGGGCACGGCGAAAC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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
4 bp inserted / 9168 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
CATCTTCGTCCCTCTTGTCAGAACAGATAAACCAGCAGTGAGATGCTAGGTGAATTCGTCTCTATTTAAACACGCACAACTGGAGTGAAAGCGAGGCGACGTGCACGAGAGCTCACTGGAAATACCTCAACACGTGTTAGGCGAGCGTGTTTCTCTCGTCACACTCCGCTCACGACATCGCTTCGTGCTTTATTCTCTATGCAGAGATTAGGCCGTTGCCAGCCTAAATGATTACTTCAGTCAACACGTTACAAGCTTGTGACACTGCAGAGCGTCCCTCTAACTGATCTGCTAAATGTCAGCAAACTGCTTTTGAGTGTAATCTTAATTTGACTTGGAATTAGTCTTTTTGCTTTGAAGATCTAATTATTCAGACAATTCTTTGCCTTGTGAGAACTTTGGGAAAAGATCAGCCATGCCATGGCTGATGAGAGAAAGAGAATGAGACAGCAAAAGAAGCAGAGAGAAAGAGATGGAGATTGTGCGATTGTGAGCGTTCC
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GAGGACACTGTTGTTCATCACCCAGTAGACCGTCATTTTGGACTTTTATTTAAGTTGTAATAACACAAAAATAAATAAAT  ...
Additional Sequence
None
Fish
Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
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