Genomic Feature

is55

ID
ZDB-ALT-221102-1
Name
is55
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one delins (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
McGrail Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Delins
Variant Location
Chr 5: 24086686 - 24099670 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
TAGCTAACATTAGCTGTCGAAAATGCAAACTTAGAGTTTCAGTATAATAGCTTTAGGTGACTTTTAGAAATCTTATGTACAGGTATGCGCATTTTTATTCATTTTTAGCTATATCTACTTGCGCGACAGAACTGTGAAGCTAATAAGCTAACGTTAAGCGGCATCTTTGCGACTCTGAGCGATCGCCTGTTTTTTAAATTTAAAGTGAATGTACATGTTATATAAATATCACACTTTGCATAAGAAACAACATCCCGACTTTTATTTTAACGTTATAGTAATTTTAGTTGTCGTGATATATTATTTCCCCCCAGGTTTTTATGACTTTCGTGTTTATAATTTCACAGCAATGGCGCAAAACGACAGCCAAGAGTTCGCGGAGCTCTGGGAGAAGAATTTGATGTAAGTTCGCAAGGGTCGCACTCCTGATACACAACGCTCCTCTTTTTCCTGCCTCTCTAAATTTCCCCGTATTTTTGTTAGCAGCCATGTCAGGTTGCTATAATGTACCTGTCTTAATATTTTTGGTGTTTGCTTGTTTAAGATGCATCTGTCGAACGTATTGTTTATCTGGAGTTCTTTGTATGAGCTTCAACAGATTAATACTAATTTCTCTCTCTTCCTTTTCAATTGTCTCAGAAGTATTCAGCCCCCAGGTGGTGGCTCTTGCTGGGACATCATTAATGATGAGGTATTTAAAAAAATAATCTCAAACACCCAGAAATCTCTATTTTCCTCTTTTGGTTTTCAGTGTTGAACTTTTGTTTGTTCTGTGTTTGCCAGGAGTACTTGCCGGGATCGTTTGACCCCAATTTTTTTGAAAATGTGCTTGAAGAACAGCCTCAGCCATCCACTCTCCCACCAACATCCACTGTTCCGGAGACAAGCGACTATCCCGGCGATCATGGATTTAGGCTCAGGTTCCCGCAGTCTGGCACAGCAAAATCTGTAACTTGCACTGTGAGTCAAAAGCGCATACACACACATACTTTCACAAATTTAATGGAAAGAGACATTTCAGTATAGTTGATCAATCTAGTAATCTTAAATTAAACATTCATAATCCATAATGAAAATATCACAAAACTGTATGTAGAAATCTGTTTGCATATGTGCCATGGTTTGCTCATAATCTGTGTAAATTATTCAGAAATAAAATTAGGGTTAGTGACAAATATGACTGATAATATACTGTATAAGTGTATGTGCAAAGTGGTTATATGATGGTAGTAAGATGGCTAACTTCAGTATGTAGCATATAGTAGTCTAAATGTGGACATGTAGCTGAAGTCATGCAGAGATGCAGGTTGTTCTTACTGGTGAGCGTTGAATCTGAATGCTGAGGATACCACACGGCTTCATTCATTCATTCTTCCCCTCCTCCTCTCCTGTGCTGAATGATATCTCAGGCCTCCTATCTTTTGTATATTCACCACTTGACTTCAGAGATGGTTGTTGTAGTCATTTAGCTCGTTGGTCTGACATCAGGTGTGGGCAAATAAGAAGATTATTTCTTACAGCATTGTCTGAAGACATGAATGGGCATGTTCTCATGTGCAGCGCCAAAAAGTTATCCGGTAGTGGTGGGGTTAAAAAAAAAAGTGACGTCGCACAGCGTACCACCCACAACCAAACCTTTTTTTTTTTCTTTCTTCAGTTGAACTATTGGTTTAGAACTTTTTAAATGCTCACTTTTTAGCCTAAATATTTACTCTGTAATCTAATAGCTCCTGTCACCCTACATGAGTGAATTGGTGCGGAATAAACTTTAGATGTTTAAATTGAATTTTGAAAACCGAGGCTATTTTATTTGCTTTAATAGTGAAATTAAAGAGAGATCATTCATTTGTGGTTAGGATCAATGATTTGATAATTAAGTCAAAAAATGTTGTTAATTTATTTTGGATGTTTAATAGATAATTATCAGGAGATGTTATGGCAAGTGAGTTTTTTTACAACGATATGTGGAAAAATTAAGTTCTTACCAAGACAAGCTGATCTGATGTTCATTCTGTCAACCGACATGGGTGAATTGGTGAATGGATAAAGTAAACGTCATATGTTTGTTTAAAGAGGTTGAGAAAAGTTGTACTATTGACTTTTTAATGTAGCAAGAAACTTTGTTTATTTTGTCAAAGCGACTTGCAGTAAAGGGACAAGCTGTTTATTATGGTGAAATTCATACAGTCAATTCCAGGATTATTATTTTAAATTGTACAGTTTAATAACTGCTCTCTTGACTACCTTTTATGAAAAGAGGTGTTGCTCTAAGATGGCTGCATGACAAAAAAAAATAAAATGGCAGCATTTGTTATTGGTCAAGAAAGCTCTTTCCCTTTCATATTCGGTTATATTAGAAGTTAGTCATATACCTCATTCAGGCAGTCTAGCTTATGTGTGTCTTATTTAATCTGACATGTTATATTTTATCAAGTCCAATAATCTGTCTTTCTTATTGATTTTAGTTTTTGTGCTTTGTTTTTGATTAGAGTTTTTGATTTCCTTTAATTTGAGGTGGAGTTTTATTGTTTAAGGCAGAATCAGTGGAGGTTGAACATGTCTGAACTTGTCCTGATTGAGCAGTGGGGGAGGGGAGTGTCTGCTTTTGCCACAGCACAAACTGCAGACTAAAACACTCAGAACAGAGATGTGTTTCGCATTTTTAAAATATCCTGGCGAACATTTGGAGGGAGATGTTGGTCTTTTTATGCATTTTTTAGGATGGAGTGTAATACATTTTAGGATTGTTAATAGTGCTGGACAGTCAAGCTGGTGCTTCACATTCTGTGTGACATTACAAGACCAGGAGGGTAAGACATTTGAAAAGACATTTAAAAGGCTTGAATGTAAGTGTGATTAAAATGTGTTAATTATTTTGTAGTTCATTAAATTAATTGGTAATTTTGTAAATCTTTGTGATGATATTGTCAAGTGATTTATGCCTGCTAATCTTTTGTTATTTTATTTAATATTATATTTGTGTTATTAGTTTATTGTTCTGTGCTAGTGAAGACGCATTAGGGTGTTTTTTAACATACTTGCATTTTAATTGAGTTAATAAGATTTGCAAATGCATATTAAAATCAGCCTTCTGGACACGACATTCTTTGAGACCGATAGTGCTTCAGTGTTGATGTTTTGATGATACATTATTGATGAGACAAATTTTTATTCACTTTAAAGGGAAAGTTGACAAAAACCTAAAAATGGTTTTACCCAACCGTCACTTACAGTTTAAACTTATTTGAATATCTTCTGTAGACCACAAAAATTAAAATAAATAAATGAATAAATACTGGCCATTGTCATTTTTCGTATTCTTTTACTATGGATATCAGTGGCCACCAATTTTAAACTTTCTTCAAAATATCTATTATGTTAACAAAAAACAGCAACGTTGGAGCCACTTGAGGTTGAGTAAATTTTAATTTTGGGGTGAACTATCTCTTTAAAGCACCAGTACTAAGGAATACCCCAGTCAATAATATCTCATATTTAATCTGCTTTCTCATTAATTTTAGTCATGATTCTTACATTAACTTGTTTAGTTTCTACCGATACTAATAAAAACTGCTTGGATGGATTATTGAACTTTTTTTTTTAAGTGCTAAACTATAACAACTGGGTGAAACTTATTTTTTTGTAATTGCAGTATTCACCGGACCTGAATAAACTCTTCTGTCAGCTGGCAAAAACTTGCCCCGTTCAAATGGTGGTGGACGTTGCCCCTCCACAGGGCTCCGTGGTTCGAGCCACTGCCATCTATAAGAAGTCCGAGCATGTGGCTGAAGTGGTCCGCAGATGCCCCCATCATGAGCGAACCCCGGATGGAGATAGTACAGACATTTTTTTTTCCATATCCATTCTTGCATCATTCTAGGCCTGCACTATTAATTGATTTTAAACCAAAATGACGATTTGAAAAGGTGTGTTTTTTTTTTGTTGTTTTTTGCCAGAAACTGTGATTATTTTGTTTATTACTATGGCGAGGGAGGCAAGTGTGTGTAATTAAAACGATCCAACTAATGTTAGTTAAAAAGCAAACAACCGTTACAGCAGACCCCCAAACCAATATGTGGAGATGAAATGAAAGCTGCTAACTTCATTTCTGCTCTGCTTCTCTCGTTCACTCTCTTGTTTTGGCTGTTACAGTGATTCTTGTGGATCCACACACGCACACGAGCACAATTTTATATATAGTTTTAGTTAAATTTAAAATACTTTAGTTATTTTCTTAATTTGTCATGACGGCTGACAACTTTATTGTATTGTATTATATAAAAAGTGGTTTCAAATAAACAGTAGCATAGTGTACTTTGTGATTATGATTGGTCTTTTTTGGTGCTGTTAAAGCCACCACATCAAACCTGCAGCTCTTAAAAAATTAGTAAATTGCATTTTTAAATTGCAATTTTGATCAGATAAATCGCAATTAGATTTTTTTTTTCAAATCGTGCAGCCCTACACTGGAATACACAAGCTAAACAATTATAAGGTGTTTACTTTTTGCACTGAAAGTTAATATCTTGTCTGTTTTCTCCCTGCTCAGACTTGGCGCCTGCTGGTCATTTGATAAGAGTGGAGGGCAATCAGCGAGCAAATTACAGGGAAGATAACATCACTTTAAGGCATAGTGTTTTTGTCCCATATGAAGCACCACAGGTTAGTCTCTCTATTTTGATCTGTTAAAAAGTCTACCAGTATTGTAGCCACTAGTTGAACCTCATTAATGCTTTTGATTTTATTTTCATGGAAGTTTAAAGTTGATATTGAAGTTGCTTTGGTATGTCACAGCCTTTTTGTAGGACCCTACCAAAATGTTGTTTTTCCCAAATGTATGTTTATGCAAACTACATTTTAGTAATGTAAGTGTGCATAGTAATGTAGTAAGTGTATAAAATGTAACCTTTAACATAACTTTTTCCTTTATTGCAGTCAAAATTAACATTTCAGAACAGTTGAGTATAAATTACTTGAATGCATTATTACATTGAGAAGTC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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
1 bp inserted / 12985 bp deleted in Intron 1 (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
ATTCTCTGTCCGTCAGGTGACGCTGACGTCACATGCTCCTCCTGTAACTAGGGGAATCCCCAAAACTCCACGCGGATTTGCTTTGTGGATGTCCAATAACCTCCTTGTTTTGGTCATTCTTTAAGTCGATCGACTACATATCCGGGCAATCCGAAAGTCGATAATCGTAGTTTAGTGGAGAGGAGGTCGGCAAAATCAATTCTTGCAAAGGTAACAAAGCGAAACTTTTATTGACTAGCGTTAGTGGTTTGATCGATCATATTTATTAACGTTAACTAGTGTTTGTAGATTCAGCTGTTTGTATATTAAGTAAAAGTCGGGATTTGGTGTGCAACATCATTGGACCGCTTGTGTGTTGTATTATTGTAACAAACTGACGTCGATTCGATAAAAACTGGTAATGAATTAAGAGTGAAACTCGTATTTCGAACTTTAGGCCCGACATCGCTTTAAACGTTACTAAAACGTTGATGTTAACGTTAGCCGCTAAGCCTGTTAGC
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Additional Sequence
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Fish
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Genotyping protocol
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