Genomic Feature
stl638
- ID
- ZDB-ALT-250225-4
- Name
- stl638
- Synonyms
-
- deletion 6165bp (1)
- Affected Genomic Region
- Construct
- None
- Type
- Allele with one deletion (1)
- Protocol
- embryos treated with
- Lab of Origin
- Lila Solnica-Krezel lab
- Current Source
- Other Pages
-
Notes
No data available
Variants
- Variant Type
- Small Deletion
- Variant Location
- Chr 17: 13020473 - 13026637 (GRCz11) (1) Details
- Nucleotide change
- ATATACGACAGGTTACCTTCATGTTCAACTTCATGAGATTCGTCCCACAAAAAAGAAATCTAGCACGCCTTTAGTCTACAGTAAATATGGTGGAAGCATGAAACACGCTCAGGATTTTAGGAGGGAATCGGTGCAGGCACTTTATTCGCGGCATCAGGGCTGGCATGGGATTCCTGCTCCAGCTCAAAGGTCACGTTCACAAAAGACGCAGTGGCTTCTGGTTGCTCCGTCTTTGGTTGTTGGTTCTCCTGATTGTGCTGCTCATCAAAACGTCGCTCTGCTTCTTCAGAGAGGCGGTTCTCCTCTTCTTCTTCATCCTCCTGCAGATTACACATTTTTAGGGTTCTCACAAGGCCAAAGCCTCATGTAGTATTTGCACTGATATCGCAGTGTGTGCATCTGCAATAGTCACAATGAAGGATCTGCAATGTTGACTTGGGAGTATACGTAGCTGACCAGGAGCCACAGATCATACCATTAGATTTGTGGAGTCATTTTTTATTTTGATGGAGAAAAGTTGGTAACACTTTACAATAAGATTGTGTTAAAGCATTTACTAACATGAACAAACAATGAACAGTGCATTTATTACAGTATTTGTTCATGTTAGCTGATGAAAATACACAGTTCATGTTAACTCAAAGTGTATAACCTAATGTTAGCAAGCATGAATTTGGATCTTAATAATGCATTAGTAAATGTTGAACTGCAATTAATAAATGCTGTACACGTATTGTTTATTATTAGCTGATGTTAGTAAATACATTAACTAATGAAACCTTATTGTAACATGTAACCAAAAGGTTTATCATTTGCATGTGTCTTTAGGGTCTGTGACTGTATGAGGATATCAAGAGAGTTCAAAGCATTCAGGCACAAGAAATTGTACCGTTTGTAACTTTCATTTTATTGAATTATTTATAGGATGAAGACTATGCAGTGCTATTTTACATTTGATTATTCAATTAATGTACCAGAATTCTTACCAAATTGAGCTATTTAAGGCATCTGGTAAAACTGTATTCATATCACAGTGTATCAGAAAAAACAAAATATCACAATGTAAGATTTTTGTGCAACCATATTAGTAACTGCTCATGTGTCAAAGATGATAAATATTTTTAAAGAGCCCCTATTTTGCATTATAAAGGGTCATATTTTGGTTTTGGGGGTCTCAAACAACAGACTAATATGCATGCAAGGTCAAAAATAATATACATTTTTTACCTAATTATCCCAATGACTCCTATATGATTCGTTCAGCTATTAATTTGTTCCCAAACCCCTCCTTAGCACAAAGCTAAACTGCGCTGATTGGGCCGATGACCGACGTCTGTTGTGATTGGTGGATTGAGTTCAGCGCGAGATGAAGAGAAAGGACCACTGAGGCTATAAAGTAGCACACGGAGTATGTGAGAGCCCAATGCAGGAATGCATTGAAGTAATGCAGTTTCTTGCCAGTTTAAAAATTCGTTTACATTGGTAAGGAAGAAGCACGCTTCGTGTTTTTAATTTGGTTTTGGATGCAATATGTGAATAGCCCCATGAAGGTTTAACCTGAGAGATACAGTACAAGCACTGATCTATTATGATTACAAGCCGTGCGGGGCGATTACAACTTATAAAACACAAATATATATTTTGCAAACTACACAAAACGATGCAACAATGTTATTTACACTTAACATGTTAGGATCCGGAGGAAGAAGAAACTGATCCATATGAACTGTACCAGTTACTGACAAAGTCCCTGTCAAAGTCTGATAAAGTCCCATACATAATAGTCTCTGCTGCTCCTTCCTCTAATAGTAAACGGCCGACGAGTCCCTGGTTACAGCGCAGGTTATTGTATCAAAAATCAGAAAAATGACTGGAACAAAATGAACTTTAACCCTTTATTCCCTACAGCTGAATCTCCATCTGTAAATGAGCCTCATCTTCGCGTCATGACCAGTCTCGTGATCCACCTCGCTCCGCTAGTGTCTGAAGGGAAAGCGCGTTCACATTTTACCAGACCTGGAACTACATATTTGGTGATGTACCGTACCGATGTTGACGCGTTCAAGCGAAAGATCCGAACTCATTCGATTCATTTATTTGACTCTGAGTCGACTATTTCGTTAAAGAATAAATAGTTTTAAAAACTGTGCTCTTTCAGATTCAAACCTCAGCTGGATGTTTTCATTCACTTAGTGCTGTATTATACATTACATGGAAGGTCATTTTCAAAAATCCATAATAAGGGCTCAATAGGGGCTCTTTTAATCGATAAAAGAAAAAAAGTATATTACAGTGTCATCTTTGACCCACAGGCTACACGAGTTAAAAATTTATTGTACTTTCACAAAAAAGAATATAAAATATATATTATAAGCTATATTACACTATATACTATATTTTTATATATAATGCACTAATTAGTGAAGGCTGTAGAATAATCCAATTTGTGTACAAACCTCCTTCTTCATCCTGTAGTATTCATCAATTGCATACTGATATTTTGGTGTTGTGATTCCCAGCAATGAGGCCATTTTCTCTCCAAGATAGTCGCAAACTGAAACATATTGGTTTAATTAATGTATTTAGACTATTTATGCAGTAGCAATTGTAACAGACTGGAGAGAGTTTCGTTACCCGAGACGGTCGAGGTCGCCACTCTCCACATTTGAAACCAAAAATATGGACCCCAGGTCAACTTGGACTACAAATCAGAGATATCAACTGTTAATGAGCGCAAGATGAAACTGAGAATGCATTAATATTCACTAATCTGATGCCACTCACCGGATCCACTGTACTTATACTGTTCTTTTTCTTCACTTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCATCGGTACTGAATTCCTCCATTGTTTCACCGCTTGCGAAGTAGATTGTTCTGCGAGGAATCTTTGGCTGTTTTTTGCCCAGATCTCCAAGTTCAACATTTTCAAACTCTTTCACCACAGCTGAAGTCTAAACAAGCAGATTATTGTTACTTAGTGGTGACTTTTTTTCAAATTTGTTTTAAGACAAAAACTGTTTTAGTTTTAATATATAGTTTAGTTTTAGTTTAACTTTGGGGCAGCACGGTGACCCAGTGGTTAGCATTGTCGCCCTACAACAAGAAGGTCTCTGGTTGGAGTCCCGACTGGGTCAGTTGCCATTTCTGTGTGGAGTTTGCATGCTTTCACCGTATTCGCGTGGGTTTCCTCCGGGTCCTCCAGATTCCCCCAGTCCAAAGACATGCACTATAGGTGAATTGAAAAAACTAAATTGGCCGTAGTGTAAGTGTGTGAATGTAAGAATATTTAGGTGTTTCCCAGTGCTGTGTTGCAGCTAGAAGCAAGTGGTGCTCGCTGCAGAGCCATTTGGGCGAGCTGAGCTCCAGCAAGGGGGAGCTTGAGCTTGAGCTCCACCTTTTTTGCACTTCTTCTACGAGTGATGTCACTGGGGGTAGGGTTAGGGGTGGGGTTGGTGTACGCATTAAAACAGCTTACAGGAGGAGGAGCGAGAGCTCATGCTCCCCCTCACTGGAGCTCAGCTCTGCTCAAATGGCTCTGCAGCGAGCACCCTCTCGCTAGAAGGGCATCCGCTATGTAAAACATATGCTGGATAAGTTGGCAGTTCATTCCGCTGTGGCGACCCCTGATGAATAAAGGAACTAAGCCAAAGGAAAATTAATGAATGAGTTCAACTTTGATAAAAGGATCTGATCCATTTCAAATGTTGACTACTGCAAGATAGACTACTCCAGATAGACTTATAATTTATATTGTTAAGTTATTGTATAATAGATTGTACTATTTTGTAATTGTAACATTTAGTTGTTCATTCATTCATTTTCTTGTCAGCTTAGTCCCTTTATTAATCCGGGGTCGCCACAGTGGAATGAACCACCAAATTATCCAGCACGTTTTTACGCCCATCCAGCTGCAACCCATCTCTGGGAAACTTCCACACACACTCATACACTACGGACAATTTAGCCTACCCAATTCACCTGTACCACATATATTTGGACTGTGTGAGAAACCAAATTATCGTGCGGATTGATAGATAGTAGGGTAGGGTTGTAGCGATTTGAGACTTTTACGATATGATAATCATCTTAGAAAATATGACGGGATATTTGTGGAGTCATTGTAAAGTATAACCATAACAGAGTGAAACTTTATAATTTGCATGCGTTTTAAAGGCATTTAAAGAAAATTTTAAGTATCCAGGTGCAAAAAAAAGTAAATGTGTAATTTTAATGAGGAGTTGTTTTACTGAATTAATACAATGAAGACTATAGAGTGTTATTTTACTTTTCATTATTCACTTATGTACCTGAATGCTGTTTGACTCTCCAGAAAACCATTAGGCACTGTTTATTTCCCTTTTTTGTTGCTCTGTTGTAATTATTTTTGCTTGCAACTTAGAAAATTACTCCAATCAATCCTAATTGATGATTTCTTTATTCCTGGTGAAGTTATATTCATATTGCAACATGTATTGCAGAAAAAGTCTCCTTTACAAAAATAAATATTTAAATAAAATTTAAAAAGTAAAGCTATACATCTCCCAGTTAAAAAACAACAACTTAAACTATTTAACAGAAAGCAAGGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGAGGGAAAAAGTGGCATTTTTAAAGATTTATTTTTTTTGGTGAAAAACTGAATAGAATTATTTAATTCTTTAACAGTTCAGTACACATGATTTGTTGAGTCATTGTGAATTTCGACCATAATCTATTAGTGTGTTTTTTTTACACTGATTCTGTAGATTTAGGGAATTTAAGAAAATTTAAACCATTTGAGAACAAAAAAATATAAAGTTTAACAAAGATTAATTGTGCTTAACTATTTATCAAATGAAGACCACACAGTGTTATTTTAGATTTAATAATTGAATTTCTTTACC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- Variant Notes
- None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
- DNA/cDNA Change
- None
- Transcript Consequence
- None
- Protein Consequence
- None
- Flanking Sequence
-
TGCTTATGCTTTAGCTTAGTGGCAGATTTAAAACAGCTAAGGATGGCTGCTTCTCCCTCAAGGCTGTTTATGCTAATGAGGGAGAGATTATCACTAATGGGAGGGGCTTTGCCCTTCGGACATGTACAAAGCGAGAATGTCAATCAAAGTGTTTCTAAAGACTGTTTATATCAAGTGTGATAAGAAAAAAATTGAATTTTGTCCATACGAAGTTATATATATATTTACAGACTGTTGCTACACCACTGTGTTTAAACCCCTTACAAAAGTGATTTTTACATAATAGGTCCCCTTTAAGACTAATCTGACAGCATCTTTATCTAGATTGATTGACAAGAGTCATGCATTTGTTGTAGTGTTAGCAGGCTTTTTAGGTGTTTACAATTATTCAAACGTACAGCGAATTGTTGTAGTGACTAAGAGAGGTTTTTATGTATGGCTTCATAAAACGATCATTCAAATAGATCTGCGTTCAAAAGCAGAGCCATTGTCAGCTATGT
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- None
Fish
Supplemental Information
- Genotyping protocol
- None