Genomic Feature

stl638

ID
ZDB-ALT-250225-4
Name
stl638
Synonyms
  • deletion 6165bp (1)
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Lila Solnica-Krezel lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 17: 13020473 - 13026637 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
ATATACGACAGGTTACCTTCATGTTCAACTTCATGAGATTCGTCCCACAAAAAAGAAATCTAGCACGCCTTTAGTCTACAGTAAATATGGTGGAAGCATGAAACACGCTCAGGATTTTAGGAGGGAATCGGTGCAGGCACTTTATTCGCGGCATCAGGGCTGGCATGGGATTCCTGCTCCAGCTCAAAGGTCACGTTCACAAAAGACGCAGTGGCTTCTGGTTGCTCCGTCTTTGGTTGTTGGTTCTCCTGATTGTGCTGCTCATCAAAACGTCGCTCTGCTTCTTCAGAGAGGCGGTTCTCCTCTTCTTCTTCATCCTCCTGCAGATTACACATTTTTAGGGTTCTCACAAGGCCAAAGCCTCATGTAGTATTTGCACTGATATCGCAGTGTGTGCATCTGCAATAGTCACAATGAAGGATCTGCAATGTTGACTTGGGAGTATACGTAGCTGACCAGGAGCCACAGATCATACCATTAGATTTGTGGAGTCATTTTTTATTTTGATGGAGAAAAGTTGGTAACACTTTACAATAAGATTGTGTTAAAGCATTTACTAACATGAACAAACAATGAACAGTGCATTTATTACAGTATTTGTTCATGTTAGCTGATGAAAATACACAGTTCATGTTAACTCAAAGTGTATAACCTAATGTTAGCAAGCATGAATTTGGATCTTAATAATGCATTAGTAAATGTTGAACTGCAATTAATAAATGCTGTACACGTATTGTTTATTATTAGCTGATGTTAGTAAATACATTAACTAATGAAACCTTATTGTAACATGTAACCAAAAGGTTTATCATTTGCATGTGTCTTTAGGGTCTGTGACTGTATGAGGATATCAAGAGAGTTCAAAGCATTCAGGCACAAGAAATTGTACCGTTTGTAACTTTCATTTTATTGAATTATTTATAGGATGAAGACTATGCAGTGCTATTTTACATTTGATTATTCAATTAATGTACCAGAATTCTTACCAAATTGAGCTATTTAAGGCATCTGGTAAAACTGTATTCATATCACAGTGTATCAGAAAAAACAAAATATCACAATGTAAGATTTTTGTGCAACCATATTAGTAACTGCTCATGTGTCAAAGATGATAAATATTTTTAAAGAGCCCCTATTTTGCATTATAAAGGGTCATATTTTGGTTTTGGGGGTCTCAAACAACAGACTAATATGCATGCAAGGTCAAAAATAATATACATTTTTTACCTAATTATCCCAATGACTCCTATATGATTCGTTCAGCTATTAATTTGTTCCCAAACCCCTCCTTAGCACAAAGCTAAACTGCGCTGATTGGGCCGATGACCGACGTCTGTTGTGATTGGTGGATTGAGTTCAGCGCGAGATGAAGAGAAAGGACCACTGAGGCTATAAAGTAGCACACGGAGTATGTGAGAGCCCAATGCAGGAATGCATTGAAGTAATGCAGTTTCTTGCCAGTTTAAAAATTCGTTTACATTGGTAAGGAAGAAGCACGCTTCGTGTTTTTAATTTGGTTTTGGATGCAATATGTGAATAGCCCCATGAAGGTTTAACCTGAGAGATACAGTACAAGCACTGATCTATTATGATTACAAGCCGTGCGGGGCGATTACAACTTATAAAACACAAATATATATTTTGCAAACTACACAAAACGATGCAACAATGTTATTTACACTTAACATGTTAGGATCCGGAGGAAGAAGAAACTGATCCATATGAACTGTACCAGTTACTGACAAAGTCCCTGTCAAAGTCTGATAAAGTCCCATACATAATAGTCTCTGCTGCTCCTTCCTCTAATAGTAAACGGCCGACGAGTCCCTGGTTACAGCGCAGGTTATTGTATCAAAAATCAGAAAAATGACTGGAACAAAATGAACTTTAACCCTTTATTCCCTACAGCTGAATCTCCATCTGTAAATGAGCCTCATCTTCGCGTCATGACCAGTCTCGTGATCCACCTCGCTCCGCTAGTGTCTGAAGGGAAAGCGCGTTCACATTTTACCAGACCTGGAACTACATATTTGGTGATGTACCGTACCGATGTTGACGCGTTCAAGCGAAAGATCCGAACTCATTCGATTCATTTATTTGACTCTGAGTCGACTATTTCGTTAAAGAATAAATAGTTTTAAAAACTGTGCTCTTTCAGATTCAAACCTCAGCTGGATGTTTTCATTCACTTAGTGCTGTATTATACATTACATGGAAGGTCATTTTCAAAAATCCATAATAAGGGCTCAATAGGGGCTCTTTTAATCGATAAAAGAAAAAAAGTATATTACAGTGTCATCTTTGACCCACAGGCTACACGAGTTAAAAATTTATTGTACTTTCACAAAAAAGAATATAAAATATATATTATAAGCTATATTACACTATATACTATATTTTTATATATAATGCACTAATTAGTGAAGGCTGTAGAATAATCCAATTTGTGTACAAACCTCCTTCTTCATCCTGTAGTATTCATCAATTGCATACTGATATTTTGGTGTTGTGATTCCCAGCAATGAGGCCATTTTCTCTCCAAGATAGTCGCAAACTGAAACATATTGGTTTAATTAATGTATTTAGACTATTTATGCAGTAGCAATTGTAACAGACTGGAGAGAGTTTCGTTACCCGAGACGGTCGAGGTCGCCACTCTCCACATTTGAAACCAAAAATATGGACCCCAGGTCAACTTGGACTACAAATCAGAGATATCAACTGTTAATGAGCGCAAGATGAAACTGAGAATGCATTAATATTCACTAATCTGATGCCACTCACCGGATCCACTGTACTTATACTGTTCTTTTTCTTCACTTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCATCGGTACTGAATTCCTCCATTGTTTCACCGCTTGCGAAGTAGATTGTTCTGCGAGGAATCTTTGGCTGTTTTTTGCCCAGATCTCCAAGTTCAACATTTTCAAACTCTTTCACCACAGCTGAAGTCTAAACAAGCAGATTATTGTTACTTAGTGGTGACTTTTTTTCAAATTTGTTTTAAGACAAAAACTGTTTTAGTTTTAATATATAGTTTAGTTTTAGTTTAACTTTGGGGCAGCACGGTGACCCAGTGGTTAGCATTGTCGCCCTACAACAAGAAGGTCTCTGGTTGGAGTCCCGACTGGGTCAGTTGCCATTTCTGTGTGGAGTTTGCATGCTTTCACCGTATTCGCGTGGGTTTCCTCCGGGTCCTCCAGATTCCCCCAGTCCAAAGACATGCACTATAGGTGAATTGAAAAAACTAAATTGGCCGTAGTGTAAGTGTGTGAATGTAAGAATATTTAGGTGTTTCCCAGTGCTGTGTTGCAGCTAGAAGCAAGTGGTGCTCGCTGCAGAGCCATTTGGGCGAGCTGAGCTCCAGCAAGGGGGAGCTTGAGCTTGAGCTCCACCTTTTTTGCACTTCTTCTACGAGTGATGTCACTGGGGGTAGGGTTAGGGGTGGGGTTGGTGTACGCATTAAAACAGCTTACAGGAGGAGGAGCGAGAGCTCATGCTCCCCCTCACTGGAGCTCAGCTCTGCTCAAATGGCTCTGCAGCGAGCACCCTCTCGCTAGAAGGGCATCCGCTATGTAAAACATATGCTGGATAAGTTGGCAGTTCATTCCGCTGTGGCGACCCCTGATGAATAAAGGAACTAAGCCAAAGGAAAATTAATGAATGAGTTCAACTTTGATAAAAGGATCTGATCCATTTCAAATGTTGACTACTGCAAGATAGACTACTCCAGATAGACTTATAATTTATATTGTTAAGTTATTGTATAATAGATTGTACTATTTTGTAATTGTAACATTTAGTTGTTCATTCATTCATTTTCTTGTCAGCTTAGTCCCTTTATTAATCCGGGGTCGCCACAGTGGAATGAACCACCAAATTATCCAGCACGTTTTTACGCCCATCCAGCTGCAACCCATCTCTGGGAAACTTCCACACACACTCATACACTACGGACAATTTAGCCTACCCAATTCACCTGTACCACATATATTTGGACTGTGTGAGAAACCAAATTATCGTGCGGATTGATAGATAGTAGGGTAGGGTTGTAGCGATTTGAGACTTTTACGATATGATAATCATCTTAGAAAATATGACGGGATATTTGTGGAGTCATTGTAAAGTATAACCATAACAGAGTGAAACTTTATAATTTGCATGCGTTTTAAAGGCATTTAAAGAAAATTTTAAGTATCCAGGTGCAAAAAAAAGTAAATGTGTAATTTTAATGAGGAGTTGTTTTACTGAATTAATACAATGAAGACTATAGAGTGTTATTTTACTTTTCATTATTCACTTATGTACCTGAATGCTGTTTGACTCTCCAGAAAACCATTAGGCACTGTTTATTTCCCTTTTTTGTTGCTCTGTTGTAATTATTTTTGCTTGCAACTTAGAAAATTACTCCAATCAATCCTAATTGATGATTTCTTTATTCCTGGTGAAGTTATATTCATATTGCAACATGTATTGCAGAAAAAGTCTCCTTTACAAAAATAAATATTTAAATAAAATTTAAAAAGTAAAGCTATACATCTCCCAGTTAAAAAACAACAACTTAAACTATTTAACAGAAAGCAAGGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGAGGGAAAAAGTGGCATTTTTAAAGATTTATTTTTTTTGGTGAAAAACTGAATAGAATTATTTAATTCTTTAACAGTTCAGTACACATGATTTGTTGAGTCATTGTGAATTTCGACCATAATCTATTAGTGTGTTTTTTTTACACTGATTCTGTAGATTTAGGGAATTTAAGAAAATTTAAACCATTTGAGAACAAAAAAATATAAAGTTTAACAAAGATTAATTGTGCTTAACTATTTATCAAATGAAGACCACACAGTGTTATTTTAGATTTAATAATTGAATTTCTTTACC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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
None
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
TGCTTATGCTTTAGCTTAGTGGCAGATTTAAAACAGCTAAGGATGGCTGCTTCTCCCTCAAGGCTGTTTATGCTAATGAGGGAGAGATTATCACTAATGGGAGGGGCTTTGCCCTTCGGACATGTACAAAGCGAGAATGTCAATCAAAGTGTTTCTAAAGACTGTTTATATCAAGTGTGATAAGAAAAAAATTGAATTTTGTCCATACGAAGTTATATATATATTTACAGACTGTTGCTACACCACTGTGTTTAAACCCCTTACAAAAGTGATTTTTACATAATAGGTCCCCTTTAAGACTAATCTGACAGCATCTTTATCTAGATTGATTGACAAGAGTCATGCATTTGTTGTAGTGTTAGCAGGCTTTTTAGGTGTTTACAATTATTCAAACGTACAGCGAATTGTTGTAGTGACTAAGAGAGGTTTTTATGTATGGCTTCATAAAACGATCATTCAAATAGATCTGCGTTCAAAAGCAGAGCCATTGTCAGCTATGT
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Additional Sequence
None
Fish
Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations