Genomic Feature

ka709

ID
ZDB-ALT-210831-2
Name
ka709
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Strähle Lab (Closed)
Current Source
European Zebrafish Resource Center (EZRC)    ( order this )
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 25: 15031604 - 15034614 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
AAGAGGGTAAGAAGGGCAAACCTGTCAACAACACTCATGTCTCGCATAAACAACCTTCTAGTCTTGTCTGTATGCTGCGCTTGCGTAAGACCTTACAGCGCTCAGCAATATCAAATTACTAATCCTCTCAAACTGGACGTACTTGCATAGGAAGGTTGTTGGCCATGGTGAAGCTTGGCATTGGTGGCAGGGCGCTGTATGTGTTCGTAAGAGCTGTGTCTGATCTGCCCAACATGGAGCCTGACGTAAAGGATACTGTTTAAAGGATAAAAATGCACACTTAGTATCTTGCTTATTAGAAGTAGTGGGTGCATTCGAGTAGATTGGGACACTTTTGCCATTGAGATGACTGGAAAACAATGTCCCAGTCAACCCAAATTTGCACTTGATTAAATAATGTTTGCTTTATTAAAATAGTATTTGCTTATCAATCATTTTCAAGCGTTTACCTGGCGTTGTGGGCTGAGGGATTGGTTGATAGACACTTGTGCTGAAGCTGCTGCTGATGGGTATGTGACTTGAGGAATTACTGGCTTGTCTTCTTTGATTTCTTAACTTTTCCTCCCTCCTCCATTTCGCTCTTCTGTTTGAGAACCAGACCTGGATGCACATATTTTTGTTTAGTTGGTGTGAATCTATATATATAGACAATTTTGCTGCAGATTTAATTTTCAAATACATATAGATTTCCATAAGGATTTCCATATTATGCAGAATAAGAGCACCTCTCTACATATTTTATACAAAAATATTGAATTTTGACAGATGAAATAACATTTTAAAATAACAAGAATAATTACTTAATTGTAGAAAGGTTTAGACTTATAAAATTATTTTTATTTTACTGAAAATATGGTACTTTTCTATATCATTATTTTCAATTTCAAATGTTTTATAGATTTTTTATGCAATTTAATTTCTCAAATGCATAAATGTGTTACAGAAACATGAAATATAACATATTTATATTATGAAATATGAACAATTAAATAAACATTCTTTAAACCATTTTAATGTACATATTTATGTTTAATTGGTTATCAATAATTAAATAGAGCAGGTAATAGAAATACAGACCCTGTAGAGTAGTATAGAGCTTAAAGGTCCCTAAAGCGCTTTGAAATGTGCAGTTTTATTCGATGTTTGACCTAATCTCAACTGAAACATGAAGACAGGGTGGAGCAAATAGTAACTCCTCCCCTTTTTGTAACAGCTCTGTCTGTGAGAGTGGTCAAGCTCAAGCACATATAGTAATAGCATCTTTAAGGGGGTGGGACATCTTAGATACTAGAGAGCATTTAATTGGTCAGAGGATTTGATGGTAAACTGATGTACATTTGACATCAGAATTATTAGCCCCACTTTGAATTTTTTTTCTTTTTTAAATATTTCTCAAATGATGTTTAACAGAGCAAGGAAATTTTCACAGTATGTCTGATATTTTTTTTTCTTCTGGAAAAAGTCTTATTTGTTTTATTTTGGCTAGAATAAAAGCAGTTTTACATTTTTAAAAAAACATTTTAAGGTCAAAATTATTAGCCCCTTTAAGCTAATTTTTTTTCGATAGTCTACAGAACAATCGTTATCCAATAACTTGCCTAATTACCCTAACCTGCCTAGTTAACCTAATTAACCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTAAAAATATCTAGTAAAATATTATTTACTGTCATCATGGCAAAGATAAAATAAGTCAGTTATTAGAGATGAGTTATTGAAACTATTATGTTTAGAAATGTGTTGAAAAAAATCTTCTCTCTGTTAAACAGGAATTGAGGAAAAATTAAATGGGTGTGGGAGGGGGGGTCTCTGCCAATTAAACTTTGGCTAATAATTCAGGGGGGCTAGTAATTCAAATCATAATTTGGCAAATATTTAAAAAAGAAAAAAATCAAAGGGGAGCTAATAATTCTTACTTCAACTGTACATGGGGGTTTATTTCCTGTTGAAACAGGAACTTTGAATGCTAATTTGTTTTTTTTTTTGGTTTTATTTTATAAAGTAAAATGTATTCATTTAGATCACAGATACTTGATAGTGATAGCGATACTAGACAGATACAAATCGATTTAGTGTGTGGGACATTCTCATTCTACAGAGCGTCTGACTGGATGGAAATGATGAGTCATCAGTATTTTTGTTGTTTCTTCTGAAGGAGAGATTTACTTGATTTATTAAAAACTAAAATGTTGTTTTCATAACAATAGTTTACATGCCAAAAATCTTGTAAAAACAAGCATTATTTGACGATGCCTATTCATCCTGTTTTTGTACATTAGTTTGTCCTGTTTTCACTCACCTGTATTCTTGCTTCTGGTAAATCTATTTTTGCAGCAAGTCTTTCTCGTGCAAAAACGTCAGGGTAGTGCGTTCTTTCAAACTCTGGTGGAAACAAACAAAAATAGGAAACATTTTGAAAATGCTACAATATTGGGCAAAAAAGTTAAATATTTGATATTTTTTAGGGCCGGGTAACTTAAATGTCCGCATTTGATTAGTTTATTACAAATAATTAATATGGCTTAAACACACTTGCTATTGATATTTTTTAAAAATGAACCATAAATATTTAGTATATTTTAGTTTAGTATAAATAGTTTATTATATTAAAATCTTTTATCTTAAGCACAAATAGTTACGTATAAACATAAATCATCACTTTATTGCAAATGCATACAAGTTTGAATCTGGAATACAGAACATAAGAATATTAATCAATTCTTTTAAGGACATATATTAAACTAGCCACATTTCAACAAGTTATATTGTTCCTAATTATTTTGTTAGTTTGTAACAGATGCTGTAATATTCGCTATAATCTCCATGTTTACCTTTTTCAAGTGCTTCTATTTGTTCTTGTGTGAAAGAAGTGCGATTCCTTTGCAGTTTTCGTTTAAGCTGAAGCCTCATTTGGGTCTCATCTGAGTCCTCGCCATTGGAGCTTATTGAGTTTGTGTTCTCACCGCCTCCG/-
Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
3011 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
TAAATATTATTTATATTACTAAATATAAATATTTTTAAACCACTTTAATATTAATAATTAAGCTTGTCATATTATGTAATTGTTAAAGAAAATGCATAAATATTTTAGGATTTTTTAAATTCAAAATTTAATAAATGTAAATGCAGAATGTTTAGGTTTTACATTTTACGTTTACATTTCTTAGAGCATGTTTCTTGATAGTGCACATTGTAGCAAAAAAAAATAATTATTATTTTGTAAATATATTATTAATTTAAATTTTAAAAAGTTCAATATTCAGATTTTAATTTTTTTTTATTATTTTTTTATTTTTTTATTTTATTTTATGCAAATTCAAATGCAAATTCTCTTACCCGTTGAGGTTGTGCCCGAGGCGGCCATTGATTGGCTGTTCATATGCGCCTGCATGTGCGGGGGTGTGTATGTGTCATAGCTCCGCCCGTTTACTGAAGGACTAGTGGGCAACATGCAGGAGTAGGATGAGGTCTGGCTGGGCTGTG
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Additional Sequence
None
Fish
Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
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