ZFIN Transcript: capn2a-202

Sequence
ENSDART00000161950 [ Show ] (double-click sequence to select)
>tpe|ENSDART00000161950.3|gene_biotype:protein_coding|ENSDARG00000091699.5 transcript_biotype:protein_coding cdna chromosome:GRCz11:13:42725712:42757565:-1
AGAGGGCAGCAGCAGTCCACCGAGAAAATAAAAATCTCTC
TCTAGTTCTGTGACGAGGAACTGGAACAGAAGAGAAGATG
GGAACTGTGATGCAAACATACAGAAGGATGCAACGTAAAA
TATTAAGGCTTAGGACCACGCCTGTGTTTGGAGGAGGAGT
GGGTGAAGGCGAACAAGCAGAAACATTTTTCTGTCAAACT
TTACAGCTGCAGAAGAGAAAAAGTTAGAAAATGTCCGGCG
TGGCATCCACACTCGCCAAGAAGAGAGCCCTGGCGGCTGG
CTTTGGGACGAACTCCAATGCCGTGAAATACCTGAACCAG
AGCTTCGAGACTTTGAGGAGTGAATGCCTGAGCCGCGGAG
AGCTTTTCTGTGATCCCGCTTTCCCAGCCGCTCCCGAGGC
CCTGGGCTTTAATGAACTCGGGCCACGGTCGTCAAAAACC
AGAGGTGTTGAGTGGAAAAGACCAGGGCAATTGACTTCCA
GTCCGGAGTTCATAGTCGGAGGAGCTACAAGAACAGATAT
TTGCCAAGGAGCTTTAGGTGATTGCTGGCTCTTAGCAGCC
ATCGCCTCTCTGACCCTTAATGAAGACGTTTTGGCTCGTG
TCGTACCATCCGATCAGGGATTTGGGCAAGACTATGCTGG
AATTTTCCACTTTCAGTTTTGGCAGTTTGGAGAATGGGTG
GATGTGGTGGTGGATGATCGATTGCCCACTAGAGATGGGG
AACTGCTCTTTGTTCACTCCGTCACAGGCTCTGAGTTCTG
GAGCGCTCTGCTGGAGAAGGCCTATGCAAAAGTGAATGGA
TGTTATGAAGCCCTTTCTGGAGGTTCCACCACAGAAGGTT
TTGAGGATTTCACTGGTGGGATTGCAGAGATGTACGAGCT
GAAAAGTGCACCGACCAACCTGTTTCAGATCATCAAGAAG
GCCCTGGACTCTGGAGCTCTGTTGGGATGCTCCATAGATA
TCACCAGTGCTGCTGATTCTGAGGCCGTCACTTATCAGAA
GCTTGTAAAGGGACATGCATACTCTCTTACTGGAGCTACT
GAGGTAAATTACAGAAGTCGAAAAGAAAAGCTGGTCCGAG
TGCGTAATCCTTGGGGTCAGGTGGAATGGACTGGGGCTTG
GAGTGATAACTCTTCTGAGTGGAACGCTGTCGATCCATCT
GAGCGTGAGAATGTGAAATCAGAAGATGGAGAGTTCTGGA
TGTCATTCTCAGATTTTGTGAGGCAGTATTCCCGCCTTGA
GATCTGCACTCTGACCCCAGACACGCTGACGTCTGACTCG
CTCAAACACTGGAGTGTGTGTAAATTTGATGGCACCTGGA
GAAAAGGCTCTACGGCTGGTGGTTGCAGGAACCATCCATA
CACGTTCTGGATGAATCCTCAGTTTAAGATCAAGCTGGAG
GAGGAAGATGATGATCCGGATGATAATGAAGTGGGCTGCA
GTGTGGTGATCGGCTTGATTCAGAAGAACCGCCGCAAGAT
GAGGAAGGCTGGAGAAGACATGCACACTATCGGCTATGCC
ATCTACGAGGTGCCTTCTCAGTTTCATGGGCAAAAGGAGG
TTCATCTGGATAAGAACTATTTCCTGACTCACGCTCAGAA
AGCTCGATCTGAAACCTTTATCAACCTCAGAGAGGTCAGC
ACCCGCTTCAAACTTCCTCCTGGAGAATATCTCATCGTCC
CTTCTACATTCGATCCGCACAAGAACGGGGATTTTTGTGT
GCGTGTGTTCTCCGAGAAACAGTCTGAGATGCAACAATGT
GATGACCCTATAGAAGCAAATGTAGATGATGAAATGGTGT
CTGAAGAAGAGGTTGATTCTGGCTTTAGGGGCCTGTTTAC
TAAACTTGCAGGAGATGACATGGAGATCTCTGCTTCTGAG
CTGCGAACGATTTTCAACAAAATAGTGGCAAAGAGAACCG
ATATCAAGACTGATGGTTTCAGTCTGGATACATGTAGGGT
GATGGTCAACCTCATGGATGAAAGTGGAAATGGAAAACTA
GGATTAACTGAGTTTGCTACACTTTGGAAGAAGATTCAAA
AGTATTTGGGCATTTATAAGAAGAATGACATGGATGGATC
CGGCTGTATGAGTACACCAGAGATGCGAATGGCTTTGAAG
GAAGCAGGATTCTCTCTGAATGACTGCATTCACCAGAGTC
TGGCTGCACGCTATGGAGACGCAGACATGACCATCGACTT
TGACAACTTTGTGTCCTGTGTGATGCGCCTGGAGATGATG
TTCAAAGTGTTCAAGAGGATGGATATAGACCACAGCGGGT
TCATTGAGCTGGACTTCTTTCAGTGGCTGTCATTTGCTAT
GATTTAAAGGCCCAGAGGATGACTATATATTTTATTGCGC
TAGTTAACTTGCACAGTTTACAATCATATGACTAAATGCT
TTACCAGTATAATGGACCACCAGGAATGTGTAAATGTGTC
CATTGTATTTGCTACAGAGAAACAAATATAATTGGCTGTT
GTTTTGTTTGTGATGCACTTTCGGTTTTTTGCCGTGCTTG
CAAGGCATCATTTTAATATTTTTTTGCTGCTGACCGTCTT
TAAAGTTGTACATCAAAGTTGTGCAAAATCAATTGTGTGC
ATGTTAGTTTCACATTGTTTCTGCCATTTCAAAAATTGCG
TTTGTTGATGACAAAATTTGTATCACATGCACTGTATTTA
AACCCTCGCATACAGCACATAAAAACTGAAGTAGTGTGCT
TTACTGTGGCCAGATGTGTAATCACCTGGTCAACAGTAAA
ATCATTTAATAAAATCTTATAGACTACAGGGATCAATTTT
TTTCATCAAAGTGTTGGCCAGTAAACAACATCCTGGCAGA
ATGTTAACCATAGTAATACTAATAACTCACTAGTATCATA
TAATCAACAGCATGAGATGTTTTTTCTATTAATTTTTGAA
TGGAACATATGGGGGTTTCCTCTGGGTTCTCCAGTTTCCC
CACAGTCCTAAGATGTGCCACAGGTGAATTGGGTAAATAA
AATTGGCCATAGTATATGTGTGTGAATGCTAGAGTGTATG
GGTGTTTCCCAGTTCTGGGTTGCAGCTGAAAGGGCATCTG
CTGTGTAAAACATATGCTGGAATAGTTGGCGGTTCATTCC
GCTGTGGCGAGCTCTGATAAATTAGAGACTAAGCCGATGG
AAAATGAATGTATGAATGAATGAATGAATATAGTAGGGAT
TGTCTTAAATGTAGACACTCCTTTATAGCATAGAACCATT
TGCTATTACTAATCATTGCATGTGCTATTAAAATTTAGAT
TTTATAGAGTCTTTAATGCACACGCTCTATTACAACTTTA
TTTTGTGGTAATCTTTGTGCAAGTTATTGTTAAAAGTGTT
GTGATTTGTATATTCAATTTCATGATGTTCCTTTAACAGC
ATTGATAGTGTAATACTTGATTTGTATTTAGAATACAGTC
AGTTAGATAGACTTATGCAGGCATGCCCAAACTCGGTCCT
GGAGGGCCGGTGTCCTGAGAAGTTTAGTTCCAACCCCAAT
CTAGCTAATCAAGCTCTTACTAGGCTTTCTAGAAACATCT
TTGCAGGTGTTTTGAGGCAAGTTGAAGCTACAATCTGCAG
GATACCGGCCCTCCAGAACCGAGTTTGGACACCCCTGGAC
TAAAGCATTCATTTAGCTGTTGAAGCATAAAGCTAGATAC
AAATATGTTTAGATATCTGACAACTGTTTTGTACATCTAT
TGAAAATACTGTGTTTATATTTTAAAGATGTGGCTCCACA
CTGTCAAAGTCGTTTCACTCGGTGGCCATCTTTGAAATGC
TTCTCAGGCAGCATGCTGGGGCATTCTGTTTAAATGATGA
AACATCAAATTCTCAAAAATTGCTTGCCAAGCTTACGACT
AAATTTTATAATACGAATCTGCAATAAAATTAAGCAACGA
CTATCTCTTTAGTTTCAATTCTAACTGTTCAAATCGCACA
AAATCTGCAGAAACACGTCTGGTCCGAGCCTTTTACTCTG
AGAATTGTCAGTCTATAGCGATCAATGATTGGCTACAGTA
CTAGACGGCAGGGCTTTATTCACTATATTTACCTTTACAC
TTTTCCCCATTCAAAACTATACGAGTGACATGTCTTGTTA
TTCTATAGCCTTTGGCACAGTGTTTCTTGTTCAGTGTGTG
AGCCACTTTAAATTTGATCTCAGTCAGGCAGTCTAGATCA
GGGGTCACCAAACTTGTTCCTGAAGGGCCATTGTCCTGCA
GATTTTAGCTCCACCCTAATCAAACACACCTGAAGAAGCT
AATCAAGGTCTTACTTGAAACACCCAGGCAGGTGTGTTGA
GGCAAGTTGGAGCTAAACCCTGAAGGGACATTGGCCCTCC
AGGCCTGAGATTGGTGACCCCTGGTCTAGATCATTGATTT
AGAACAGTCTTAAACTCAATTCCCGGAGGGCCACAGCTCT
GCATAGTTTAGCTCCTACCACCTCCAACTTTACACCTGCT
TAACAGTCTCTAGTAGTCTTGAACACCTTGATTAATTGGA
TCAGCTGTGTTTGATTAGAGTTGGAGCAAAACTGTGCAGA
GCTGCAGCCCTCCAGGAATCCAGTTTGAGACCTACAGTAT
GATTTAGAACAAGGCAGGTCTTCAAAAATAGTGACCATAT
ATATTGACAGGACCGTTCAACAGAAATGCTTAGGCTGGCT
TATCAAAATCTACAGTCATTTGTTGTTTTCTATACTTTTA
AATGGAATTTAAGACTTAAGTTTATCAAGTGTGCCTCTCT
TTGATGCCTTGCAAGCACTGTTTTTATCTGGTGTTTCCTT
GTGTAAACGGAACATTGTATTGTGGACCATTTGGAATTTA
TAATGCAAACAATAATATTACAGCCTTGTTGCTGTCCATT
AAATAAAGTTATCTTTTATTATTTTTGATATTATTATTTT
TTATGTTCTTGGGAAATTTTATTTCTATTTCTATAACATG
AATGGGATATTTTACCCAATAAATTCTGTCATCATGGACT
ATTGATGTGAATGGCTACTTCTTCCAGCATTCTTCAGAAT
GTTTTGTTTTGGGTTCAAAAAAGAAGAACACCTTAAAGCA
GTGTTTCTCAACCATGCTCCTGGAGGACCAACAGCACTGC
ATGTTTTGGATGTCTCCTTTGTCTCTCACAGCCATTACAG
GTCTTTGAATCTCTGCTAATGAGCTAATGATCTGAATCCG
ATGCGTTTGGTTAAGGAGACATGGAAAATGTGCAATGCTG
GTGGTCCTCCAGGAACGTGGTTGAGAAACACTGCCTTAAA
GAGCATACGTGTTTTTTTATTTCAGAAATATTAAAATAAT
GTGAGTTTTCCATTCTTTGGATTTTTTAAAATTAAAATTT
CATATAGACAGACTTTATAATCAGATTGTCAAACGTGTGA
TTTTAAT
Related Transcripts
Transcripts related to capn2a
Type	Name	Annotation Method	Has Havana Data	Length (nt)	Analysis
mRNA	capn2a-201 (1) Ensembl	Ensembl		4,462 nt	Select Tool ZFIN BLAST
mRNA	capn2a-202	Ensembl		5,407 nt
Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations