ZFIN Transcript: si:dkey-32n7.4-201

Sequence
OTTDART00000050671 (1) [ Show ] (double-click sequence to select)
>tpe|OTTDART00000050671|OTTDARG00000035588|ZDB-GENE-110411-175 si:dkey-32n7.4|OTTDARP00000039786 DKEY-32N7.4-001 LG_ AL954132.14 Danio rerio protein_coding NOVEL, 5121 bp
ATTCATGGCACTGAAGTTCCCCAACCGAAGGGGAACCCCA
CTGTGTTGGAGTTATCAAAATGCGCACACACGTGTGACGC
ACTAGAGGGAAGGGCGATTTGTCCGGCGAGGCGGCGACTT
GGATTTCCTGACATATCCTGACATTTCATCATTTCATTAA
AAAATTACGACGTCACCCTAAGCTAGGCTAAAAAGTGCTC
CTGCAAGACCTGGGGATCGATGGAAGGGATTCAAAAGTGT
CGATGCTTGCACCACTTTTCACAACTAAGACTCACTTCTG
ACACATCTGACTTGTCTGCCTCCCCTCATGCACCCTTCAG
TTCTACATCTGACAGATCATGATGGATTGGTACTCCTACA
TCAGTTTATGCATCTTCTGTGTGCCTCAGTCAGTGATGAC
TTTTAACGTGGATCATGCTGCCTGGAAAACTTTCACTGCA
CCACTGACCAATAATGTTGCCTTTGGCTACAAGGTGATAC
AAGAAGACATGACAAGACTGACTGTGAGTGATCCTTTAAT
TCAAATCAATCGTGATGAAAGAGGACAGATTTATAGTTGT
GATGTCAATCGAGGAACCTGCTCATCATTGAATATTTATG
GTAGAGTTCCCTCTGAAGCAGTCAACATGTCTTTAGGACT
TTCCATGGTTAAAGATCCAGGCTCTTCAAAGCTGGTGGTT
TGTGGTCCAACCATTCCAAAGAACTGTCCAGGAGTGTCCA
CCTACAATGGCATGTGCTTTGTTAATGAACACAGAAGAAG
TTTTACAGGTCCAATACCCAGCTCTCTGAGAGAATGCCCC
AAATCACAAATTGATATTGCTTTTTTATTGGATGGATCTG
GAAGTGTAGATCCTGTGGATTTTAATAAGATGAAGGCTTT
TGTTGTAGAAATGATCAAGAGTTTTATAGACCGTGACACA
CAGTTTGCAATAGCACAGTTTTCTACAGAATGTGTCATTC
ATTACAAGTTTCAACAAGTCAAAAACCCTGCCTGGTGGCA
AAGAGCAGTGAATGGGATACAACAAACACATGGATGGACT
TTCACTGCAACAGCTATAAGACTGCTTGTGGAGTCATTAT
TTGTAAGTAGTGGAGGTGCAAGACAATCAGCCAGTAAAAT
TCTGGTCGTCATCACGGATGGAGAATCAAACGATAAATTT
TTGACTGAAGCTGTTCAACAAGCACAAGAAAAAAGTATAA
CACGATATGCAATTGGGGTCGGTAATGCTTTCAATAAATA
CAGTGCAAGAAATGAGCTAACGGTTATTGCATCCATACCC
ACCGATAAGCATGTGTTCAAAGTTACCGATTTTGATGCTC
TGGAAAGCATTCGGGAAATACTTAAAGAGAACATTATTGC
CATCGAAGGAACCCAGACGTCTGGAGATTCATCTCGAATG
GAGTTTGCACAGGATGGGTTTAGTGCAGCACTGACATCAG
ATACGGATTTGATCATGACTGCAGTTGGAGCTTTTCAGTG
GAAAGGTGGATATCAGCTCTTCAAATTAAACGACCAGACA
AGTGTCTTTCAAGCTGGAAGTGAGCATAACAGTTATTTAG
GTTACTCCCTGGCAATAGCGACAGTGTATAATACGAAGTA
TGCAGTCATGGGGGCGCCAAGACACAAGCATGAAGGACTA
GTTACAGTTACACGAATTGATCGAATGAGCGATCAAATCC
AACTGGATCCTCCCAAGACTCAGATTGGCTCTTATTTTGG
AGCTGAGGTGTGTGTGGTGGATTTGAACAGTGACTCTAAT
ACAGATCTGCTTCTGGTATCAGCACCGACATACACAGAGT
CTGAGCGAGAGGGGAAAGTGTTTGTTTATAGCTACACACG
TCGGCCATTCTTCAGTTTTTCTGATGTGGTGCTGGTGGGC
ATGGCCGGTCAGAGGGGTCGATTCGGCTCTTCTCTGGCCA
GTCCAGCAGATCTGAATGGTGATGGTTTTAAGGATGTGCT
GGTTGGTGCACCGTTAGAGGAGGATGGAAAGGGTAGCATC
TACATCTTCAATGGACGAGATGGAGGGATCATTTCATCAT
ACTCCCAGAGGATTGCTGGATCATCTGTGCAGTCAGGATT
GCAGTACTTTGGTGTTTCCTTGAGTCAATCCTCTCCAGAC
CAGACTGCAGACAGCCTTCCTGACATTGCTGTTGGGTCCA
AAGGAGCAGTTCTGCTTCTCAGGTCCAGACCCATCATGCT
CTTGGAAACAAAAGTGTCTTACAACCCATCCAAAATATCA
ACTGGTCACACAGATTGCAAAAACCAATTGCAGACCACTC
TGATCGTGTGCTTCACCATGAAAGGATACAGGCATCACAA
AAGAGATTTGAATGCAAAAATTACTTACAACATAACTCTG
GATGCTAAGAGACAGAATCATCGAGCATTCTTCTCAGCCA
AAGACAATCTCCTCAGTAATGTGATTGACATTGGGAATAC
AGAAGTTTGCAAAAATCATGATTTCTTAATAGAGGCTTGT
CCAGAAGATGCTCTGAATCCATTGTCCAATCAGTTAAAAT
TCACCTTTGAGGGTCTGCCATCTAGTCAAATGCAAAACCT
GAGGCCAATACTGCTGCCAGAGATAAAGACCACCTCAGAT
CACGATCTGGATTTTGAGAGAGAATGTGGAAAAGATAATG
TATGTGTTGATAATCTCAGAGTGGATTTCAATTTCTCTGG
ATCTACTAATATAGAAGTGGGGATAATGCAGGAGATCAAC
GTGACGGTGTTTGTCGAGAACAGAGGAGAAAACTCATACA
ACACACACTTCACCCTCAATTACCCATATGGATTTTCATA
CAGGAGAATCACATCAAAACAGGGCAGAGTAGAGTGTTCG
TCTCTGGATGGAGAGCAAGGGGTTCGACTGGGAGAAACTG
AATGCGCCATCAGTAAACCCATCCTCAAGGATAATACTAA
GATTGTGTTTGAGATTACGTACAGCATTAATAAAGAAGTT
ACACTGGGACAAAACGTGATATTCAGTGCTTCAGTCAAGA
GTGGGAATGACAAACACTCTGAAAGCAGCGAGTTATCGAA
AAAGAAAAGCATTGATGTGAAATATGGCATCTATGTCGCC
CTGATCCGGCATGAAAATTCCACCATCCACATCAACTTTA
CTTCAGGGAAGAAGGATCTTTCAAAACCCGTCCAGCAGAC
AATAAAGATTGAAAATGACCTCAGACCGTTAGCTTTCACA
GCTTTCATCAGAGTACCATTGAAGCTTGGTGATACCGACA
TCTGGAAAGAATCTACTTTGCAAGTTTCTGACTGTGTGAA
AAATAAAACGGAGAAGCCTAGTGTTACAAATTATATGGAT
GATATTAAAAAACATCATGTACTGAACTGCAGTGTGGCGG
TGTGTGCCGTGTTTATCTGTGATGTCAATCTCATAAAGAA
TGAAAGGAAGCTCTATAATATTACTGGCAATGTGAGCTCT
GCGTGGATTGAGCAGACTGGACTCAAAAGCGCTGTGTTTG
AGCTGGTCAGTACAACCACTATGGATTACGACATGAGCAC
ATATGTTTTCTTTTCCTCGGATTCCAGAAACACGGCGCCG
TCTTTACAGATCAGCACTCAGGTGGAGGTTTATGAGGAGG
TGGACCTGACAAAGGAGATCATTGGAGGAGTGATTGGAGG
ACTTGTGCTGCTGGCTCTCATCACTGCGGCCCTCTATAAG
GCTGGGTTCTTCAAAAGCCAGTACAAGCAGATGATGGAGG
AGGCACAGGGAGAAGAAGCGCCACAATAATGTGCACTCAA
ACAGTTATGGGATACTGATTGAGTTCTGTGGGATTTACAG
TCACACATATTTAACCCTATAACTGAGGGATGTCAAACTC
AATTCCTGGAGGGCCGCAGTCCTGCATAGTTTAGTTCCAA
CCCTGCTCCAACACACTTACCTGTAGGTTTCAAACAAGCC
TGAAGGACTCAATTGGTTTGATCAGGTGTGTTTAATTAGG
GTTGGAACTAAACTGTGCAGGACTGCGGCCCTCCAGGAAT
TGAGTTTGACTTCTCTGCTTTAACTGGTGCCCCACTTTTT
AAACAGATATAAAAATTACATGTTCAGTTTAAATTAATGC
CAATCTTAGATGCTGTGGTGCATAGATTTAAATTTGGTCT
AATTTTAAAGACAGATGTCAGATTTTAGCTGAAGGGAAAA
ATGCTCAAATAAAAGTTGTGCCATTTTGTTTATAAAAAAA
ACTTTTATTTTTTAGTATTTTACATACTAAAACATGGTTT
TACCAAAATCAAGCTAAATATCTGATCAAATTACTGTATA
TTCCAATTTTGAAATGTCTCAAAAAAAATAATAAGCCTGT
GAGTATTATTTTGTTGGACCGCAATACCAAACATGACCAC
TAAATAACATCCAGTTTATATTGGTGACAATACAAGGGCG
CCCCCTATGTTTTAAGGAACAAAACCATGTTTTATTCATA
CATTTGACTGTATTTGTAAAGTAAACCTAAATTCTAAAGT
ACTATGGGCAGTTTGATGGTATTTGGTTGGAATTTAGACT
CTATAGTGGATTGCTGTAGCAAAGTAATGCTTTACGACTC
TGAATAGTATCCTTGTAGGAAATTAATAAAGAACTTTTGC
TCAGTAATATCTAACTAAAACTGTCACCAGATATGAAAAC
TAGAAAGTTTACACTTTTAAACGCTTATTAGTTTGTTGTC
ATGTTTGCTTTGTTTAGGCTACAATATTATGGTTTAAAAC
CGTAAATGGTCCCACAGGTTGTAGGGTGACAGTAATCTGT
GTTTAAATCTATTATTCATACATAACACAAACAAGTAACA
GACCTTTCCAATGATATATATTTAGTCATTATTAGATAGG
GACTTTAATGAAAAAATGTCGTAAACATAATTGTCCTGGT
AGCAGAACAGTGACAGTGATGAACAACTAATATACTAAAA
TATTTTACTTGAAATGTTATTAGAAATGTTGTATTGGATA
GGCACACGGTTATTGAGATGTTTTCTTTTAAATTATCTAA
ACATTTTTTTTATCATTGTCTCTGGGTGTTTTGAAAATGT
TTAATGCTGTATATACAGTATACAGTTGAAGTCAGGGTTT
TTAGCGCCCCTTTGATTTTATTTTCTTTTTTAAATATTTC
C
Related Transcripts
Transcripts related to itgam.1
Type	Name	Annotation Method	Length (nt)	Analysis
mRNA	si:dkey-32n7.4-201	Havana	5121 nt
mRNA	si:dkey-32n7.4-202 (1) Ensembl	Ensembl	3411 nt	Select Tool ZFIN BLAST
Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations